Productora de Haruhi las Novelas, la version anime los derechos son de Kyoto, o en todo caso co-productor porque dudo que Kyoto renuncie a los derechos, alli seria bastante estupido, es como renunciar a los derechos de la gallina de los huevos de oro ^^, me imagino a la editora del Potter llevandose la pasta de las peliculas y Warner solo cobrando por hacer las muvis xDDD.
Muy diferente por ejemplo a Type Moon que no solo hace los juegos sino que suele participar en la producción de los animes, lo mismo Nitro plus
Kyoto Animation como tal no tiene derechos de distribución, tiene parte del copyright por ser estudio de animación pero hasta ahí. Tienen libertad creativa y tal, pero sus jefes son los de Kadokawa que son los que ponen la pasta para que se lleve a cabo el proyecto.
La cosa es más o menos así:
1. "Compañía X" publica un producto <manga/light-novel/novela/videojuego>
2. El producto sale al mercado y llena las expectativas de la "Compañía X"
3. Si la "Compañía X" desea producir una animación del producto, bien puede hacer públicas sus intenciones a nivel corporativo, con el cual diversos patrocinadores puedan embarcarse en el proyecto (lo que significaría más dinero para el anime)
4. Selección del estudio de animación:
4.1. Un estudio de animación Y hace saber que está interesado en producir la adaptación animada del producto. Se aprueba su participación en base a estándares corporativos y otras cosas, o invierten algo en el proyecto (hay varias posibilidades).
-- o ---
4.2. Se busca un estudio de animación que pueda producir la serie y para ello se estudian las tarifas y demás cosas, hasta llegar al estudio que llene las expectativas (económicas en su mayoría, sobre todo en esta época).
-- Después vienen otros pasos que culminan con el anime en la TV ---
En estos casos, la compañía es el jefe mayor, el estudio de animación es apenas uno de los que hacen posible el anime, pero su peso no es mayor al de la compañía.
Claro está que, para nosotros, es más importante el estudio de animación que otra cosa, porque nos avocamos a ver y disfrutar un anime, criticar la QUALITY, etc., y pasamos de los procesos empresariales que están detrás de la creación de tal o cual serie.
Otros casos: Un estudio de animación quiere desarrollar un proyecto original y para ello busca financiamiento (patrocinadores, socios, etc.), se aprueba el proyecto y se emite la serie en TV (o se lanza como OVA o película). En este caso el estudio de animación es el jefe mayor y es quien ocupa el primer puesto en cuanto a los derechos del proyecto.
Bueno, con eso termino el off-topic xD, espero que sea de ayuda para quienes tengan dudas sobre el proceso de producción de los animes. Estaré atentos a los comentarios o críticas en caso de que haya algún error en lo descrito anteriormente

.
Volviendo al tema:
En fin... esto es tan estúpido como romper los libros de Harry Potter por que no te gusto como adaptaron la película.
Las personas que hicieron esto son unos ignorantes idiotas que han de estar forrados de pasta:
+100
Lo hacen para llamar la atención o porque tienen problemas emocionales.
Cuando vemos una peli en el cine y no nos gusta, no lanzamos las palomitas a la pantalla, ni gritamos "¡Qué porquería!". Después de verla la comentamos con amigos, expresando nuestras críticas, pero no decimos "¡Vamos a quemar el estudio XYZ por hacer tal aberración!", es cuestión de raciocinio.