De hecho asi fue.
El anime salio cuando el manga iba por el volumen 3 por lo que se distancia la historia y mientras en el anime...
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a falta de material se inventan al agente de MI5, a la "niña" vampiro y al demonio Incognito y en el capitulo final se ve un texto diciendo que enconotraron y detuvieron al creador del chip que creaba vampiros artificiales
por otro lado en el manga...
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tras la muerte de los hermanos Valentine comienzan a reconstruir la organizacion contratando a los "soldados de la fortuna", un grupo de mercenarios lidereado por Pip Bernadotte(el que mencionan aparece en otro manga del autor) y continuan con una batalla a gran escala contra un grupo de Neo Nazis quienes eran los creadores del chip. Mas no puedo decir porque este arco argumental al igual que el manga en si aun no terminan...esta por salir el volumen 8 apenas.
Los ovas de Hellsing Ultimate no se ha dado informacion de si seran continuacion del anime o reiniciaran la historia(pues en el trailer se ve a los hermanos) pero por el resto de imagenes se aprecia que estaran mas orientados a la historia original del manga de lo que estubo la serie.