Maebara Keiichi se establece en el tranquilo y pacífico pueblo de Hinamizawa. Rápidamente hace amistad con las chicas de su escuela, llegó justo antes del gran festival anual. Algo anda mal con este pueblo, sus miedos y emociones crecen sin parar. Un profundo miedo carcome sus pensamientos, ¿cuál será el secreto de este oscuro pueblo?

Under the Dog toma lugar en el año 2025 en Neo Tokyo, cinco años después del devastador atentado terrorista en las Olimpiadas de Tokyo. A raíz de la tragedia las Naciones Unidas forman una unidad encubierta con el único propósito de eliminar a los responsables del ataque. Anthea Kallenberg, una chica de ascendencia suiza, es miembro de este grupo de élite que ha perfeccionado sus habilidades en combate convirtiéndose así en la asesina perfecta, pero tiene que descubrir quién es en realidad.