Sinopsis

Conan, Ran, Sonoko, Kogoro, el Dr. Agasa y los chicos detectives llegan a la pequeña y turística isla de Koumijima gracias a que resolvieron un acertijo de un diario, ganando el premio. Esa isla es un lugar donde se dice que hace 300 años había estado unas piratas legendarias llamadas Anne Bonney y Mary Read. Según los rumores, habían escondido un tesoro en algún lugar. Aprovechando esta leyenda se llama a los turista, pero al mismo tiempo a cazadores de tesoros de todo el mundo.

Conan y los chicos deciden participar en un juego de búsqueda del tesoro que ofrece la agencia de turismo. Mori y el Dr. Agasa deciden pasear por el pueblo, en cambio, Ran y Sonoko prefieren bucear en el océano. Sin embargo, mientras miraban unas ruinas hundidas bajo el mar son atacadas por un tiburón y se dan cuenta de que uno de los cazadores de tesoros está herido y acorralado por los tiburones. En el hospital, Conan se da cuenta de que no fue un accidente y comienza a sospechar que hay algo que tiene que ver con el tesoro de las legendarias piratas...